RUMİNANTLARIN SİNDİRİM KANALINDA BULUNAN Piromyces sp. ve Anaeromyces sp.’İN KARBONHİDRAT AKTİF ENZİM (CAZymes) ETKİNLİĞİ
Özet
Karbonhidratların dehidrasyonu sonucu di-tri-polimer yapılı organik bileşikler ya da
karbonhidratların hidrolizi sonucu monomer yapılı bileşikler oluşabilmektedir.
Karbonhidratların dehidrasyon ve hidroliz reaksiyonlarını katalize edebilen enzimler
Karbonhidrat-Aktif Enzim (CAZyme) olarak bilinmektedir. CAZyme sistemi içerisinde
bulunan enzim gruplarının glikozit bağları üzerinde etkili olan ve glikozidazlar olarak bilinen
enzimler EC 3.2.1 enzim ailesine bağlıdır. EC 3.2.1. enzim ailesi β ve α glikozit bağı ile
meydana gelmiş polimer yapılı karbonhidratların katabolizmasında etkilidir. Ruminant
hayvanların ana besin kaynağı olan bitkisel substratlar selüloz, hemiselüloz ve ksilan gibi
farklı karakterden oluşan karbonhidratlardan meydana gelmiştir. Ksilan β-1,4 glikozit bağı ile
ana omurgaya α-2,3 arabinoz ve α-1,2 glukuronik asitin bağlanması ile oluşan organik
bileşiktir. Selüloz ise β-1,4 glikozit bağlı glikoz monosakkaritlerinden meydana gelmiş ve bir
çok lignoselülotik yapının dehidrasyonu sonucu oluşmuş polisakkarittir. Bundan dolayı bu
substratların hidrolizinde görevli olan ksilanaz (EC 3.2.1.8) ve selülaz (EC 3.2.1.4)
enzimlerinin aktivitesi oldukça önemlidir. Ana besin maddesi bitkisel materyal olan ve bu
materyalin hücre duvarındaki bileşenlerin tamamının hidrolize uğrayabilmesi için sindirim
kanalındaki flora ile herbivor canlılar arasında sıkı mutualist bir yaşam döngüsü kurulmuştur.
Herbivor hayvanların sindirim sisteminde bulunan karbonhidratların fermantasyonunda
görevli olan mikroorganizma grubu glikozit hidrolaz etkinliğine sahiptir. Ruminant
hayvanların sindirim kanalında simbiyotik olarak yaşayan rumen bakterileri, rumen
fungusları, metanojenik mikroorganizmalar, protozoalar ve bakteriyofajlar gibi
mikroorganizmaların sahip olduğu CAZyme etkinliği sayesinde oluşan monomer bileşikler
hem herbivor canlı için hem de kendi aralarında başka bir kimyasal reaksiyon için substrat
kaynağı oluşturmaktadır. Özellikle rumen funguslarının sahip olduğu glikozit hidrolazların
etkinliği oldukça önemlidir. Çünkü rumen funguslarının bitki çeperine kolonize olma yeteneği
ve sahip olduğu ökaryotik enzim aktivitesinin diğer flora üyelerine göre daha yüksek oranda
olması bu fungusların CAZyme etkinliğini ön plana çıkarmaktadır. Çalışmamızda ruminantların sindirim kanalında doğal yayılış gösteren rumen funguslarından monosentrik
dallanma gösteren Piromyces sp. ve polisentik dallanmaya sahip olan Anaeromyces sp.’nin
sahip olduğu glikozit hidrolaz-CAZyme etkinliğine ait olan ksilanaz (EC 3.2.1.8) ve selülaz
(EC 3.2.1.4) enzim aktivitesi hesaplanmıştır. Enzim aktivitesi Miller yöntemine ait olan DNS
metodu ile gerçekleştirilmiştir. Sonuç olarak Anaeromyces sp.’nin hem ksilanaz (105
µmol/dk/ml) hem de selülaz (86 µmol/dk/ml) etkinliğinin fazla olduğu tespit edilmiştir.
Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
-
SKA 12: Sorumlu Üretim ve Tüketim
-
SKA 13: İklim Eylemi
Atıf için künye
Yücel, H., Ekinci, K., & Karaman, A. (2022). RUMİNANTLARIN SİNDİRİM KANALINDA BULUNAN Piromyces sp. ve Anaeromyces sp.’İN KARBONHİDRAT AKTİF ENZİM (CAZymes) ETKİNLİĞİ. 8th INTERNATIONAL MARDIN ARTUKLU SCIENTIFIC RESEARCHES CONFERENCE, Mardin (ss. 1030–1038).
BibTeX
@inproceedings{yucel2022-292040,
author = {Yücel, Halit and Ekinci, Kübra and Karaman, Altuğ},
title = {RUMİNANTLARIN SİNDİRİM KANALINDA BULUNAN Piromyces sp. ve Anaeromyces sp.’İN KARBONHİDRAT AKTİF ENZİM (CAZymes) ETKİNLİĞİ},
booktitle = {8th INTERNATIONAL MARDIN ARTUKLU SCIENTIFIC RESEARCHES CONFERENCE},
address = {Mardin},
year = {2022},
pages = {1030--1038},
url = {https://akademik.atauni.edu.tr/yayinlar/292040-ruminantlarin-sindirim-kanalinda-bulunan-piromyces-sp-ve-anaeromyces-spin}
}