Molecular Characterization and Phylogeny of Meloidogyne chitwoodi Golden, O'Bannon, Santo & Finley 1980 Obtained from Potato Production Areas in Turkey
Özet
<jats:p xml:lang="tr">Meloidogyne chitwoodi, birçok Avrupa ülkesinde zarara neden olan istilacı bir nematoddur. Bu tür, Türkiye'nin kuzey, batı ve doğu bölgelerinde patates yetiştirme alanlarında sorunlara neden olmaktadır. Bitki paraziti nematodlarının tanımlanması temelde morfolojik özelliklerin ve morfometrik parametrelerin gözlenmesiyle gerçekleştirilmesiyle yapılmakta fakat, bu yöntemlerde benzer özelliklere sahip birkaç türün varlığından dolayı tanımlama güçlükleri bulunmaktadır. Yayınlanmış orijinal betimlemeler ve tanılama anahtarlarının kullanılmasıyla her zaman doğru tespit yapılamamaktadır. Bu nedenle, bu çalışmada patates örneklerinden izole edilen Meloidogyne chitwoodi örnekleri, JMVhapla-JMV1-JMV2 primer setleri ile A PCR tabanlı tanı yöntemi ile moleküler olarak ve morfolojik olarak tanımlanmıştır. PCR reaksiyonları sonucu % 2 agaroz jel elektroforezinde 540 bp bantlar elde edilmiştir. Ayrıca çalışmada yerel popülasyonların diğer Meloidogyne türleri ile ilişkilerini araştırmak için için filogenetik analiz ve ikili uzaklık değerlendirilmesi yapılmıştır. Bu amaçla, M. chitwoodi'nin DNA sekansları, BLAST kullanılarak GenBank sekans karşılaştırmasına tabi tutulmuştur. Filogeni çalışmalarından sonra popülasyonların M. chitwoodi Türkiye popülasyonuna % 99 ve diğer popülasyonlara % 99 benzer olduğu tespit edilmiştir. Yayınlanmış yerel izolatların diğer sekansları ile karşılaştırıldığında bu çalışmadaki izolat, Nevşehir (KF557791.1) izolatı ile oldukça benzerlik göstermiştir.</jats:p>
Anahtar kelimeler
Atıf için künye
Aslan, A., Dinçer, D., Behmand, T., Özarslandan, A., Öztürk, L., & Elekcioğlu, İ. H. (2023). Molecular Characterization and Phylogeny of Meloidogyne chitwoodi Golden, O'Bannon, Santo & Finley 1980 Obtained from Potato Production Areas in Turkey. KSU TARIM VE DOGA DERGISI-KSU JOURNAL OF AGRICULTURE AND NATURE, 26(1), 62–69. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.946513
BibTeX
@article{aslan2023-291311,
author = {Aslan, Ayşenur and Dinçer, Dilek and Behmand, Tohid and Özarslandan, Adem and Öztürk, Lerzan and Elekcioğlu, İbrahim Halil},
title = {Molecular Characterization and Phylogeny of Meloidogyne chitwoodi Golden, O'Bannon, Santo & Finley 1980 Obtained from Potato Production Areas in Turkey},
journal = {KSU TARIM VE DOGA DERGISI-KSU JOURNAL OF AGRICULTURE AND NATURE},
year = {2023},
volume = {26},
number = {1},
pages = {62--69},
issn = {2619-9149},
doi = {10.18016/ksutarimdoga.vi.946513},
url = {https://akademik.atauni.edu.tr/yayinlar/291311-molecular-characterization-and-phylogeny-of-meloidogyne-chitwoodi-golden-obannon}
}