Ramnolipid üretme potansiyeline sahip bakterilerin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu

Geleneksel mikrobiyolojik yöntemlere dayanarak mikroorganizmaların sınıflandırılması, tür bazında teşhis için yeterli olmamaktadır. Bu nedenle, günümüzde bakteri sistematiği açısından, 16S rRNA gen dizilimini, filogenetik ağaçlar ile karşılaştırmalı analizini, ilgili organizmalar ile DNA-DNA hibridizasyon çalışmalarını, moleküler markırların analizlerini, biyokimyasal analizlerini, fizyolojik ve morfolojik özelliklerini kapsayan hem fenotipik, hem de genotipik yöntemlerin kullanılması gerekmektedir. Mikroorganizmaların taksonomik pozisyonunu belirlemeye yönelik bu genotipik, kemotaksonomik ve fenotipik yöntemlerin tamamı, bakteriyel sistematik için "polifazik yaklaşım" olarak bilinen olguyu oluşturur. Bu çalışmada, ülkemizin çeşitli bölgelerinden toplanan su, çamur, toprak ve petrol atığı örneklerinden, ramnolipid üreten bakterilerin kültür koleksiyonu oluşturulmuştur. İzole edilen test suşlarının, morfolojik fizyolojik ve biyokimyasal özellikleri belirlendikten sonra 16s rRNA gen sekans analizleri yapılarak moleküler düzeyde identifikasyonu gerçekleştirilmiştir.