Atatürk Üniversitesi Atatürk Üniversitesi
Ara
Projelere dön
Proje Tamamlandı TÜBİTAK Projesi

Sucul Kınkanatlılar Takımından Bazı Familyalara (Dytiscidae, Hydrophilidae ve Helophoridae) Ait Böcek Türlerinin Sindirim Yapılarında Bakteri Mikrobiyotasının Tespiti ve Türler Bazında Karşılaştırılması

Figen Orhan (Yürütücü), Mehmet Bektaş (Araştırmacı), Özlem Barış (Danışman (Yürütücü Gerçek Kişi Olan Projede)), Ömer Köksal Erman (Danışman (Yürütücü Gerçek Kişi Olan Projede))

TÜBİTAK 2020–2021

Proje özeti

Canlılar

dünyasının tür çeşitliliği bakımından en zengin gruplarının başında gelen

böceklerin; beslenme, yaşam alanı ve farklı yaşam ortamlarına uyum bakımında büyük

bir çeşitlilik gösterir ve bu durum da organizmaların vücut florasından yeni

tür ve suşların izalosyon şansını artırmaktadır. Ayrıca böcek mikroflorasının

bilinmesi onların beslenme fizyolojisi, bağırsak ekosistemleri, çeşitli

mikrobiyal hücumlardan etkilenme veya onlara direnç gösterme mekanizmaları vb.

konuların aydınlatılması hususunda da önemli ipuçları vermektedir. ‘Sucul kınkanatlılar takımından bazı familyalara (Dytiscidae, Hydrophilidae

ve Helophoridae) ait böcek türlerinin sindirim yapılarında bakteri

mikrobiyotasının tespiti ve türler bazında karşılaştırılması’ başlıklı

çalışmamızda sucul kınkanatlılara ait böceklerde bağırsak

kültüre edilebilen bağırsak mikrobiyotasının tesbiti, fenotipik ve genotipik

yöntemlerle karekterizasyonu amaçlanmıştır.<o:p></o:p>

Bu çalışma kapsamında Erzurum ve çevresindeki

farklı lokalitelerdeki sucul ortamlardan 25.05.2020-12.09.2020 tarihleri

arasında toplanan böcekler kullanılmıştır. Toplanan örneklerin tür teşhisi

yapıldıktan sonra sindirim kanalı laboratuvarda aseptik şartlar

altında disekte edilip ayrıştırılmış ve bekletilmeden mikrobiyolojik analizleri

yapılmıştır.<o:p></o:p>

Mikroorganizmaların identifikasyonunda moleküler

yöntemlerin, konvansiyonel bir yöntem olan API 20E multi test sistemi ile desteklenmesi

amaçlanmıştır. Bu nedenle enterik

bakteri olduğu düşünülen 25 adet örnek seçilerek API 20E (biomerieux) testi ile

karakterizasyonunu yapılmıştır. Ardından API testi ile uyguladığımız izolatlara

ilave olarak farklı olduğunu düşündüğümüz örneklerden de seçilerek toplam 67 adet

izolat, PCR

reaksiyonu ile çoğaltılıp

16S rDNA genleri çoğaltılarak baz

dizi analizi belirlenmiştir. Elde edilen DNA dizileri

BLAST analizi sonrasında, izolatların moleküler ve konvansiyonel

verileri birlikte değerlendirilerek isimlendirilmiş ve GenBank kabul numaraları

alınmıştır. Çalışmamız sonucunda 140

adet bakteri izole

edilmiş olup bunlardan basit karakterizasyon yöntemleri ile farlı olabileceği

düşünülen 66’sı tür ya da cins düzeyinde tanımlanmıştır.