Bir Boz Ayıda (Ursus Arctos) Bulunan Taenia Solium'un Tüm Genom Sekanslama (Wgs) Ile Genomik Doğrulaması Ve Filocoğrafik Genotip Tayini
Proje özeti
Taenia solium (Linnaeus, 1758), önemli halk sağlığı ve
ekonomik sorunlara neden olan zoonoz bir parazittir. Bu paraziter zoonozun son konağı insan, ara konağı
metasestodlarını taşıyan domuzlardır, ancak insanlar da kazara ara konak görevi
görebilmektedirler. Sistiserkuslar merkezi sinir sistemine yerleşme
eğilimindedir ve nörosistiserkoza neden olarak nörolojik semptomlara yol
açmaktadırlar. Ayılar üzerinde
yapılan çalışmalar incelendiğinde Kaliforniya’da siyah ayıların iskelet
kaslarında Cysticercus cellulosae tespit edilmiştir.
Ancak ayılarda erişkin T. solium bildirimine ilişkin bir kayda
rastlanmamıştır. Tür
tanımlama çalışmaları geleneksel olarak Sanger dizileme kullanılarak cox1 gibi
standart genetik barkod bölgelerinin analizine dayanmaktadır. Bu yaklaşım,
moleküler tür tanımlama için uzun süredir yaygın olarak kullanılan bir
yöntemdir ve DNA barkodlamanın temelini oluşturmaktadır. Ancak, genomun sadece küçük
bir bölümünü temsil ettiği için, sınırlı filogenetik ve tür içi ayrım sağlar. Bu
sınırlamalar, daha kapsamlı whole genome yaklaşımlarının kullanılmasını zorunlu
kılar. Bu projede, tek bir gen bölgesine odaklanmak yerine, Tüm Genom
Sekanslama (WGS) stratejisi benimsenmiştir. Bu
çalışma ile ileri moleküler tekniklerle parazitin tam anlamıyla tanımlanması ve
dünya literatürüne kazandırılması hedeflenmektedir.